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浙江大学第52期基因组科学研习班

  • 发布日期:2017-06-28 点击次数:52
  • 专 业:基础医学
  • 会议类型:学习班
  • 会议日期: 2017-08-18
  • 会议地点:浙江--杭州
  • 主办单位:浙江大学    
  • 推荐等级:
  • 会议费用: 3800元
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会议介绍

首席医学会议频道(conference.9med.net)2017年06月28日报道,浙江大学第52期基因组科学研习班将在浙江杭州召开。

会议详情

  上机实习内容:

  1.基因组数据注释和功能分析;2.转录组数据分析;3.蛋白质结构与功能分析;4.系统生物学软件实习;5.蛋白质组学数据分析。

  随着众多生物基因组测序项目的完成,生物学数据正在加速度增长。如何科学地分析和注释这些高通量数据,已成为生物学工作者急需学习和解决的问题。

  浙江大学“基因组科学”研习班邀请北京基因组所于军教授、胡松年教授为您讲授基因组学基础知识和前沿进展、基因转录组的测定及分析、二代测序等实验技术的关键事项;浙江大学杨军教授、陈铭教授等讲解系统生物学及高通量分析研究方法和思路。

  本研习班多次获得浙江大学优秀项目创新奖,目前已举办51期,学员来自全国30余个省市,累计培训学员5100余名。每次研习班不乏教授、博导参加,更受到博士后、硕博生等年轻学者的青睐。他们中有一些带着课题或问题前来交流和联系,不少学员通过本研习班建立了长期协作关系,共同申请国家973、863课题,共同发表论文,其中不少优秀的研究成果,已在SCI期刊上发表。

  一、培训班上课内容

  上课内容涵盖“基因组学—蛋白质组学—系统生物学”的研究方法、技术思路、前沿进展及其在各生物学科中的应用。

  核心课程包括:

  1.基因组的比较研究、DNA测序技术原理与进展(讲课人:于军教授)

  2.转录组的测定与分析、大规模测序方法及应用、微生物基因组学、基因组学与精准医学(讲课人:胡松年教授)

  3.系统生物学建模分析及高通量分析技术应用(讲课人:杨军、陈铭教授等)

  4.蛋白质组学概论及应用(讲课人:钟伯雄教授)

  二、培训班上机内容

  上机实习课采用“跟我学”方式,学习实践各类基础生物信息学软件,每人一台PC机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法。

  主要内容如下:

  实习一:基因组数据注释和功能分析

  通过序列比对工具BLAST的学习,了解基因功能注释的原理;介绍多序列联配工具ClustalX及分子进化分析软件MEGA4,掌握系统发生树绘制的基本方法,认识基因复制在进化上的功能。

  实习二:转录组数据分析

  介绍转录组数据分析的基本流程及其原理;通过对tophat、cufflinks、R等转录组数据分析工具的介绍及演示,了解基于二代测序数据的转录组分析流程及常用分析方法;利用kegg、GOstat、DAVID等在线工具挖掘转录组数据的生物学意义。

  实习三:系统生物学软件实习

  使用TM4软件来实现芯片的数据采集,低质量过滤,标准化处理及聚类等可视化分析;使用GenMAPP软件挖掘芯片数据在代谢途径中的生物学意义;介绍NCBI GEO数据库,学习检索和提交芯片数据。

  实习四:蛋白质结构与功能分析

  从数据库搜索感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始,接着对蛋白质基本理化性质、二级结构、和三维空间结构和序列模体进行分析,预测目标蛋白的生物功能。

  实习五:蛋白质组质谱分析

  利用Cytoscape系统生物学分析软件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子网络系统,并与基因表达等数据整合。

  三、培训对象

  1.无生物信息学背景,希望了解生物信息学的学员;

  2.计划开展各类组学研究的科研人员;

  3.已有组学数据需了解分析方法的研究人员;

  4.有志从事生物信息学相关工作的学生或者技术人员。

  四、报名方法

  若有参加意向,请直接报名,我们会即刻回函并在浙江大学继续教育系统录入,待排定课表后发给您详细课程表。待您再次确认后,发给您报到通知并排定上机号。培训结束,发放浙江大学继续教育证书。

  五、教材

  “DNA和蛋白质序列数据分析工具”(第三版),薛庆中等编著,科学出版社出版2012年6月发行。

  “基因组学概论”(第二版),薛庆中等编著,科学出版社出版2016年1月发行。

联系方式

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