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2017重庆表观遗传学及DNA甲基化数据分析

  • 发布日期:2017-11-02 点击次数:137
  • 专 业:基础医学
  • 会议类型:讲习培训班
  • 会议日期: 2017-11-24
  • 会议地点:重庆--重庆
  • 主办单位:N/A    
  • 推荐等级:
  • 会议费用: 3900元
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会议介绍

首席医学会议频道(conference.9med.net)2017年11月02日报道,2017重庆表观遗传学及DNA甲基化数据分析将在重庆召开。

会议详情

  一、培训特色:

  主题明确,针对性强,理论和实践结合,主讲与学员研讨的方式进行;

  授课专家拥有丰富的表观遗传学数据分析和项目执行经验;

  课下主讲老师为您所遇到的问题提供个性化解答;

  配合研究中所需的要点,围绕实际研究中常用的软件展开;

  学员通过与专家直接交流,能够分享到顶尖学术机构的研究经验和实验设计思路。

  培训内容

  一、表观遗传学研究现状及未来发展

  二、表观遗传学相关的数据库介绍与使用

  三、高通量测序技术概述

  四、常用生物数据文件类型介绍与格式转换

  五、代测序数据质控、比对分析与可视化

  六、常用在线工具和数据库使用操作

  一、DNA甲基化原理、应用及研究方法、微生物基因组

  1甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)

  2亚硫酸氢盐测序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)

  3 高分辨率熔解曲线法(High Resolution Melting,HRM)

  4.比较各项甲基化研究方法存在的优缺点等

  二、DNA甲基化数据分析策略

  1 WGBS分析:利用fastqc和perl脚本对原始数据进行质控

  2 之后用bismark进行mapping和beta值计算

  3 R的methylKit包筛选差异甲基化位点并用pheatmap包和ggplot2包进行可视化

  4.PeakAnnotator对 这些位点进行功能域和基因注释,最后用DAVID进行GO和 KEGG 通路注释

  DNA甲基化调控案例讲解

  DNA甲基化测序数据分析上机实战

  三、DNA甲基化芯片数据分析上机实战

  1芯片DNA甲基化分析

  2利用R的IMA包进行差异甲基化位点鉴定并用pheatmap包和ggplot2包进行可 视化, 用DAVID进行GO和KEGG通路注释

  一、染色质可及性测序技术

  二、组蛋白修饰原理与分子功能

  三、组蛋白修饰功能

  四、核小体定位图谱分析实战练习

  五、组蛋白修饰数据分析实战练习一

  六、组蛋白修饰数据分析实战练习二

  一、还原真实染色,质构象--HiC技术

  二、TCGA与ICGC,数据库介绍与使用

  三、干细胞的表观遗传学研究

  四、转录因子ChIP-seq数据分析

  五、生存曲线分析

  非编码RNA研究及数据分析

  1. miRNA研究的综合解决方案;

  2. miRNA研究的数据分析(芯片、测序);

  3. lncRNA研究的综合解决方案;

  4. lncRNA研究的数据分析(芯片、测序);

  5. Agilent相关技术在非编码RNA研究中的应用。

  报名办法及费用:

  每人¥3900元(含报名费、培训费、资料费等相关费用),不含食宿费用,食宿可统一安排,费用自理。

联系方式

张爱国
手机:13683111214
电话:010-58032788
邮箱:zky_im@vip.126.com
单位:北京中科云畅应用技术研究院

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